A disputa em segundo turno para presidente foi acirrada: Lula venceu em 14 estados, enquanto Bolsonaro obteve vitória em 12, e no Distrito Federal. Enquanto o petista venceu em todos os estados do Nordeste, os eleitores de apenas uma das capitais da região preferiu o atual presidente. Maceió foi a única capital que deu a maioria de votos para Bolsonaro.
Na capital de Alagoas, Bolsonaro teve 49,59% dos votos válidos, frente a 40,43% do Lula. Em todas as outras oito capitais da região, Lula venceu. Já Salvador, pelo contrário, foi a capital em que Lula teve o melhor desempenho: 66,99% (1.022.728) dos votos válidos e Bolsonaro, com 24,07% (367.452).
João Pessoa, capital da Paraíba, teve a disputa mais acirrada. Lula ficou à frente de Bolsonaro, com 47,38% (217.243), contra 44,48% (203.971) do ex-presidente.
Confira o desempenho de Lula e de Bolsonaro nas capitais do NE (votos válidos)
| CAPITAL | LULA | BOLSONARO |
| Maceió (AL) | 40,43% (195.714) | 49,59% (240.053) |
| Aracaju (SE) | 52,56% (176,981) | 37,08% (124.846) |
| Fortaleza (CE) | 53,20% (802.009) | 35,17% (530.162) |
| João Pessoa (PB) | 47,38% (217.243) | 44,48% (203.971) |
| Natal (RN) | 50,15% (225.529) | 42,01% (188.942) |
| Salvador (BA) | 66,99% (1.022.728) | 24,07% (367.452) |
| São Luís (MA) | 56,50% (345.123) | 34,40% (210.140) |
| Recife (PE) | 54,03% (538.562) | 39,22% (390.904) |
| Teresina (PI) | 62,37% (301.309) | 28,63% (138.320) |